產(chǎn)品特點
1. 本試劑盒是專為一步法 RT-PCR 實驗研制,去除基因組DNA、逆轉(zhuǎn)錄和PCR在一反應(yīng)體系中進行,反應(yīng)過程中無需添加試劑,無需打開管蓋,在避免污染的同時提高了檢測靈敏度和實驗效率。
2. 本試劑盒包括極其靈敏的去除基因組DNA 的酶,可在瞬間徹底清-除殘留的基因組還有全新高效逆轉(zhuǎn)錄酶、快速熱啟動 DNA 聚合酶,同時包含適用于逆轉(zhuǎn)錄和 PCR 擴增的反應(yīng)緩沖液和實驗中所必需的其它組分。SuperRT 逆轉(zhuǎn)錄酶RNaseH活性缺失,減少了逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中 RNA 的降解。該逆轉(zhuǎn)酶逆轉(zhuǎn)錄效率高,可對少量RNA模板進行良好的逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。
3. PCR反應(yīng)使用的快速熱啟動DNA聚合酶具有擴增效率高、特異性強、延伸速度快的優(yōu)良性能。獨特的緩沖體系使逆轉(zhuǎn)錄酶和聚合酶同時發(fā)揮大功效。使用本試劑盒擴增得到的目的產(chǎn)物 3′端附有一個″A″堿基,可直接用于T/A克隆。
保存條件
長期保存,請置于-20℃,有效期 12 個月。使用后請及時放入-20℃保存以保證酶
的活性。
使用方法
1.將 RNA 模板、引物、2×OneStep RT-PCR Mix(with gDNase)和RNase-Free Water 溶解并置于冰上備用。
2. 按下表加入試劑,至終體積 20 μl:
試劑
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20μl反應(yīng)體系
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終濃度
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2×OneStep RT-PCR Mix
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10μl
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1×
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Forward Primer,10 μM
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0.5μl
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0.25μM
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Reverse Primer,10 μM
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0.5μl
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0.25μM
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RNA Template
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Xμl
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1pg -1μg
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RNase-Free Water
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up to 20μl
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/
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注 意:
引物濃度請以終濃度 0.1-1.0μM作為設(shè)定范圍的參考。擴增效率不高的情況下,可提高引物的濃度;發(fā)生非特異性反應(yīng)時,可降低引物濃度,由此優(yōu)化反應(yīng)體系。3. 渦旋震蕩混勻,短暫離心,將溶液收集到管底。
4. 設(shè)置反應(yīng)程序,將 PCR 管置于熱循環(huán)儀中,進行 RT-PCR 反應(yīng)。
反應(yīng)條件:
過程
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溫度
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時間
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去除基因組 DNA
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37℃
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5min
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反轉(zhuǎn)錄
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50℃
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5-30min
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PCR預變性
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95℃
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2min
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30-40cycles
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變性
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95℃
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30sec
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退火
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55-65℃
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30sec
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延伸
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72℃
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1kb/30sec
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終延伸
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72℃
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5min
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注 意:
A. 一般 PCR 實驗中退火溫度比擴增引物的熔解溫度 Tm 低 5℃,退火時間一般為20-30 秒,無法得到理想的擴增效率時,適當降低退火溫度;發(fā)生非特異性反應(yīng)時,提高退火溫度,由此優(yōu)化反應(yīng)條件。
B. 延伸時間根據(jù)擴增的片段大小設(shè)定,本產(chǎn)品中包含的 DNA Polymerase擴增效率為1 kb/30s。
C. 可根據(jù)擴增產(chǎn)物的下游應(yīng)用設(shè)定循環(huán)數(shù)。循環(huán)次數(shù)太少,擴增量不足;循環(huán)次數(shù)多,錯配機率會增加,非特異性背景嚴重。所以,在保證產(chǎn)物得率的前提下,應(yīng)盡量減少循環(huán)次數(shù))
5. 反應(yīng)結(jié)束后取 5 μl 反應(yīng)產(chǎn)物,加入適量上樣緩沖液后進行電泳檢測結(jié)果。
注意事項
1. 在操作過程中應(yīng)避免 RNase 污染,防止 RNA 降解或?qū)嶒炛械慕徊嫖廴荆ㄗh在專門的區(qū)域進行 RNA 操作,使用專門的儀器和耗材,操作人員帶口罩和一次性手套并經(jīng)常更換手套。
2. 實驗盡量使用一次性塑料器皿,若使用玻璃器皿,應(yīng)使用 0.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在 37℃處理 12 小時,并在 120℃下高壓滅-菌 30 分鐘后使用,或者將玻璃器皿在180℃下干熱滅-菌 60 分鐘后使用。實驗中用到的無菌水應(yīng)使用0.1%的DEPC處理后進行高壓滅-菌。
3.本試劑使用前請上下顛倒輕輕混勻,盡量避免起泡,并經(jīng)短暫離心后使用。使用后應(yīng)盡快放回-20℃,避免反復凍融。
4.本試劑盒必須使用特異性引物,引物的選擇可根據(jù)具體實驗來選擇,引物設(shè)計的好壞直接影響到 RT-PCR 反應(yīng)的結(jié)果,設(shè)計引物時需考慮 GC 含量,引物長度,引物位置,PCR產(chǎn)物的二級結(jié)構(gòu)等因素,建議采用專業(yè)的引物設(shè)計軟件來設(shè)計。